新型 V4エンジンを搭載したPanigale V4の登場によって11代目Ducatiスーパーバイクへと突入した2018年モデルでは、初代851シリーズ（旧くは1974年のレーサーレプリカ750SS）から搭載されてきたデスモドロミックLツインのフィナーレを飾る記念モデルもラインナップされていた。それが1299パニガーレ R ファイナルエディションである。
新型エンジン搭載のニガーレV4が214馬力を発揮するのに対し、1299Rファイナルエディションのそれは209馬力なのだが、1299 R FEには、歴代ホモロゲ機（レース参戦用の市販車）に付与されてきた「R」が冠されている。
そもそも1285ccとSBKレギュレーションをオーバーしている本機の「R」には、1988年の851機から2017年のパニガーレRまでSBKで17度の年間タイトルと330回以上の勝利を収めてきたLツインへのオマージュが込められている。
登場2018年モデルの本機1299 パニガーレ R FE（Final Edition）のメーカー希望小売価格は421万円（以下いずれも税抜）であった。同年のPanigale V4は244万円、前2017年のベースグレード1299は232万円、先代17年のホモロゲ機Panigare Rは370万円と比べて高価な設定となっている。
電子制御のテクノロジー、豪華レーシング仕様の足回りなど上位グレードへの専用装備は先代1299SやパニガーレSから継続しているのだが、高価な理由でもある1299 R FE固有の特徴は以下となる。

・パニガーレRのフレームに1299のエンジンを搭載
・Final Editionスーパークアドロ エンジン
・軽量化されたクランクシャフト
・圧縮比の変更13.0:1（1299は12.6：1、パニガーレRは13.2：1）
・吸気バルブ径を48mm、排気バルブ径を39.5mmにボアアップ（1299は46.8mmと38.2mm）
・専用設計された旧排気ダクトとカムシャフト
・新設計のスリッパークラッチとクラッチバスケット
・最大209馬力/11,000回転（1299/Sは10,500回転時205馬力、パニガーレRは11,750回転時196馬力）
・ベースグレード比1.5kg重い168kgの乾燥重量
・1299外装に赤/白/緑のトリコロールカラー仕上げ
・トップブリッジに機種名とシリアルナンバーの刻印
・シートカウル下左右2本出しのAKRAPOVICオールチタンエキゾースト
・赤く塗装されたMarchesini鍛造ホイール

パニガーレRのフレームに1299のエンジンを搭載している本機。主な変更点は吸排気系のチューンと外装の特別デザインに集約される。
吸排気バルブ径アップ、圧縮比向上、軽量クランクシャフトの採用などエンジン機構の見直しによって1299/S比で4馬力アップし最大209馬力まで高め、新設計のクラッチ構成ユニットの採用で乗り味を向上させる機能的なアップデートに加えて、トリコロールカラーやシート下左右2本出しのエキゾーストに赤塗装のホイールが映える特別記念モデルである。

売る際のリセールバリューだが、世界を見渡してもタマ数の少ない本機。国内の中古販売価格は300後半から400万円台前半の値付け、米国では300～400＄台のプライスタグを下げて販売されているが買取相場は上記の6～7掛けとなることからベースグレード1299と比べて倍、先代パニガーレR比で6～7割高い査定額が見込める。

解説記事更新日：2022年11月20日

2018年に登場した1299パニガーレ R ファイナルエディション。機種判定において唯一のエビデンスとなるフレーム型式はHC02A型が設定されているのだが、これは1299シリーズとは別系統の設定である。
DUCATIスーパーバイクは、「無印」ベースグレードと上位グレード「S」にホロモゲ「RまたはSP」の3グレード展開を基本とし、「トリコ」や「コルセ」などのバリエーションも含めて同排気量のシリーズには一部の例外を除いて同じフレーム型式が設定されてきた。
例えば、1299シリーズはH905J型、1199シリーズはH802J型、1098シリーズはH704型、999シリーズはH400A型、V4シリーズはDA0型であった。
一部の例外とは、SBKレギュレーションの縛りによって1299シリーズと併売された、1299外装に1198ccエンジンを搭載したパニガーレRがH902J型。999シリーズのホモロゲ「R」が H401Aであったのだが、兄弟関係である事が伝わる近しい設定となっていた。
本機1299 Panigale R final editionにシリーズとは異なるフレーム型式が設定されたのはLツイン最終の記念モデルとして、先代で枝分かれしていたパニガーレRのシャシーに、1299で搭載していたスーパークアドロ エンジンに専用チューンが施されたFinal Editionスーパークアドロ エンジンを積んでいることが理由かもしれない。
421万円（以下いずれも税抜）のメーカー希望小売価格での登場となった1299ファイナルであるが、同年のライバル機ではCBR1000RRの最上位グレードSP2が283万円、YZF-R1Mが285万円、ZX-10Rが14,399US$、GSX-R1000R が17,199US$となっていた。
ちなみに1299ファイナルの北米化価格は39,900US$であった。

解説記事更新日：2022年11月20日

仕様上の変更なく引き続きトリコロールカラーでイヤーモデルを重ねた2019年モデルの1299 パニガーレ R ファイナルエディション。
トップブリッジのシリアルナンバーが刻印されている本機だが限定限定のLimited Editionではなく2018～20年モデルでラインナップされていた。
赤/白/緑のカラーリングは、旧くはMHR（Mike Hailwood Replica）を、最近では1098 S トリコローレを踏襲し、SBKで330回以上の勝利を重ねてきたLツインをオマージュする記念モデルであることを象徴している。
北米での販売価格は前年に引き続き39,900US$で据え置かれた。

1285ccの本機はSBKのレギュレーション（2気筒1200cc/4気筒1000ccまで）から外れているのだが、踏まえてライバル機である同年のZX-10RとSSの重要指標パワーウェイトレシオを比較してみよう。
・ZX-10R＝1.01kg/ps（装備重量206kg/最高203馬力）
・1299 R ファイナル＝0.91kg/ps（装備重量190kg/最高209馬力）
と加速力で大きく上回る本機だが、ZX-10Rの北米価格は15,099US$と魅力的な設定であった。ちなみに17年モデルのベースグレード1299 Panigaleは25,795US$であり、豪華な足回りに専用のチューンが施されたことでライバルと比べ高価な設定となっていた。その分買取時の査定額が高いのも本機である。

解説記事更新日：2022年11月20日

2020年のDucatiスーパーバイクは955 Panigaleからモデルチェンジを果たしたパニガーレV2が新たにラインナップに加わることに。
2018年・19年と世界で最も売れたスーパースポーツとなったことで、フルモデルチェンジで成功を収めたパニガーレV4シリーズは3代目スーパーレッジェーラとなるSuperleggera V4を1,086万円（以下いずれも税）で新たに投入。
1299 パニガーレ R ファイナルエディションも2020年モデルでラインナップされていたが、前年に引き続き仕様上の変更なく引き続きトリコロールカラーのキャリーオバーでモデルライフを終えることに。
DUKATIの特別モデルに配されるトリコロールカラーが目を惹く本機だが、1299で搭載していたスーパークアドロエンジンは専用のFinal Editionへとアップデートされている。
具体的にはインテーク＆エキゾーストバルブのボアアップ、吸排気ダクトを設けたシリンダーヘッド、軽量化されたクランクシャフト、新設計のカムシャフトの採用、圧縮比の向上などの変更を受け従来比で最大4馬力のパワーアップを果たしている。
北米向けの販売価格も登場から引き続き$39,900USDに据え置かれた。

1285ccの本機はSBKのレギュレーション（2気筒1200cc/4気筒1000ccまで）から外れているのだが、踏まえてライバル機である同年のCBR1000RR-R SPとSSの重要指標パワーウェイトレシオを比較してみよう。
なお2020年モデルのCBR1000RRはフルモデルチェンジを受けトリプルアール（RR-R）へと進化している。
・CBR1000RR-R SP＝0.92kg/ps（装備重量201kg/最高218馬力）
・1299 R ファイナル＝0.91kg/ps（装備重量190kg/最高209馬力）
格下排気量ながら214馬力のパニガーレV4すら超える218馬力を発揮するCBR1000RR-R SPであるが、カタログ値ベースでは加速力は僅差ながら1299 R Finalに軍配が上がる。
ちなみに20年モデルCBR1000RR-R SPの北米価格は$28,500 USD（国内価格は253万円）と魅力的な設定となっていたが、データロガーDDA+などの付加装備では1200 R Finalに分がある。
リセールバリューでは現行型であるRR-Rに分があるが、型落ちとなった今も買取額ベースでは1299R Finalが高い。2020年モデル 1299 Panigale R Final Editionの買替や売却をお考えでしたら買取査定はその中古価値に精通しているバイクパッションに！

解説記事更新日：2022年11月20日